箭头I为HMW-UK被纤溶酶水解后产生LMW-UK的切割位点；箭头2为纤溶酶活化单链尿激酶的切割位点；EGF为E区域；k为kringle区域尿激酶的轻链部分含有丝氨酸蛋白酶家族共同的活性中心由组204，天冬255和丝356组成。其轻链上带有唯一糖化点天冬酰胺302。scu-PA的重链根据其二级结构和相应的功能，以及其外显子的编码，可从N-端始划分为以下几个区域：①E区域，其氨基酸排列和二级结构相似于上皮生长因子(epidermal gr。wth fac-t。r)的结合部位，包括第5-49位氨基酸。②K区域，其特征相似于纤溶酶原的kringle结构，包括第50-135位氨基酸。⑧连接多肽，包括第13 6-158位的氨基酸。凝血酶可以作用于重链c一末端的精156一苯丙157之间的肽键，从而灭活尿激酶。
各种不同形式的尿激酶具有不同的生化和生物特性。按照其体外激活谷一纤溶酶原的速度来排列，HMW-tcu-PA>LMW-tcu-PA>scu-PA。尿激酶可以直接活化纤溶酶原，不需要纤维蛋白作为辅助因子。HMW-UK对谷一纤溶酶原的亲和力比LMW-UK大约2.5倍，其活化谷一纤溶酶原的速度比LMW-UK快近3倍。测定二者对小分子发色底物的活性时，HMW-UK与LMW-UK无显著区别，提示N-端多肽对UK的活性具有影响。动物实验证实，人们需用2倍于HMW-UK的LMW-UK量才能获得相等的溶栓效果。
scu-PA激活纤溶酶原的活性仅为HMW-tcu-PA的0.5-1%，这一生物学特征与sct-PA相似。在体外反应中，scu-PA激活谷一纤溶酶原的速度亦呈多价指数曲线上升，其原因为①产生少量纤溶酶迅速地将scu-PA转化为tcu-PA。②产生少量纤溶酶将谷一纤溶酶原降解为赖一纤溶酶原，使反应速度进一步加快。另外，在反应体系中还会产生LMW-UK。
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