农药是“三农”的重要生产资料，主要用于农作物、林果、牧草病虫杂草鼠害等有害生物的治理和防除，并调节农作物的生长发育，保障它们安全正常完成生长、成熟、收获，使人类得到理想的收成和经济效益，满足人们对农、林、牧产品日益增长的需要;其次也用于杀灭和控制危害人畜的蚊、蝇、虱、蚤、嶂等非农业的卫生和健康害虫及其病菌，使人畜安宁，稳定的生活，健康的成长。。但是它在给人们带来利益的同时，也造成了危害。例如:危害人畜健康造成中毒死亡;大量杀伤天敌和其他有益生物，破坏生态“食物链”，打乱生态平衡;污染大气环境，毒化土壤、水域，使自然失缺和谐，形成“二次中毒”，恶性循环。
    这些危害为人们所理解，我们可将其列为“显性危害”或“暴露危害”。另外还有一类危害，在较短时间内并不暴露或显示出来，有的要经过较长的时间才日渐被人们所察觉和体验出来。例如:甲磺降、绿黄隆和其他一些除草剂，对收茬作物毒害影响其正常发芽、生长、分孽、成熟而减产;滴滴涕、六六六等有机氯和某些有机磷农药的富集作用积累到一定的数量和程度，对人畜和其他动物会造成慢性中毒，导致“三致”— 致癌、致畸、致突变;滥用农药使害虫、病菌产生抗药性，导致农药治虫、防病失去作用，造成巨大经济损失，并形成某些害虫再猖撅等等。这些暂时看不见的危害，我们把它称为“隐性危害”或“潜在危害”。农药残留一般是针对土壤中生长的植物，在向土壤施肥或者直接在植株上施肥时，都可能将农药残留在农产品内。对于土壤的性质，我们一般会需要了解土壤水分的含量，土壤中养分的含量等等的参数。其中土壤水分含量用土壤水分测量仪来获得。同时我们可以利用土肥仪来测得土壤中养分的含量。全自动定氮仪和蛋白质测定仪都是测量蛋白质含量的仪器。不过全自动定氮仪是通过确定氮的含量，从而来确定蛋白质的含量。当然还有更为全面的仪器，可以测定土壤中很多养分的含量，如氮、磷、钾等等元素。土肥仪就是这么一款仪器，能够测定土壤中很多中养分的含量。农药在农产品和食品上的残留也是一种“隐性危害”。农药残留不仅污染大气、土壤和水域，毒化和危害自然环境，更直接残留在作物各个部位，污染农产品及其加工制成的各种食品，影响农产品和食品的质量，使其成为带“毒”的农产品和被污染的不卫生的有“农残”的副食品、主食品，直接危害人们的健康，引发社会恐慌，甚至动乱，并成为社会不稳定、不和谐的因素。
农产品和食品的农药残留还影响着出口贸易的进行，导致贸易经济的下降。中国加入WTO后，进出口贸易大大提高。2004年农产品出口甚至到达全世界第五。但是，发达国家对农产品和食品的农药最高残留限量很严格，特别是日本，美国和欧洲，对农残标准极为苛刻。
    日本自2006年5月29日起施行《食品残留农业化学品肯定列表制度》，欧盟从2007年4月1日起实施即将出台的《化学品注册、评估、许可和限制制度》(简称‘REACH”法规)。这是两个典型的、有针对性的贸易保护法规，也是杀人不见血的两柄利剑，两道“鬼门关”。日本的《肯定列表》将原来只对25种农业化学品，在186种农产品、食品中设立9321个限量标准，分别增加到796种化学品，30种农产品，53862个限量标准。也就是说，日本从我国进口的农产品要检测的项目中，每一次检测的项目:大米579个，茶叶276个，猪肉428个，一棵白菜要检测20个项目，最多的一种农产品要检测50个项合格后才能通关。对于一些暂时没有“药残”标准的农产品、食品设立了一个所谓“一律标准”值为0.0lm吵9，也就是说，1000t农产品或食品中，药残不得超过1g。这些标准真是太刁钻了，连发达国家也达不到，世界上没有第二个国家有这样繁琐狠毒的“农残比”。由此可见，农药残留已经成为农产品国际贸易的技术性“绿色”壁垒，常常引起经济贸易纠纷和摩擦。出口的农产品和食品被进口国以农药残留超标为借挡在国门外，通不了关，不仅造成经济损失，而且影响国家形象和民族尊严，还导致农产品出口竞争力减弱或下降，乃致国家间外交关系不和谐，不协调，甚至成恶交。因此一个技术性的农药残留问题不仅仅是一个经济问题，也是一个外交问题和政治问题。
    由上文可以看出，农药残留的危害巨大，无论是对人体的健康，还是国家的经济，甚至是国家的外交政策等，都有一定程度的影响。
原中国军科院总工程师、中国公益事业联合会、中国爱心工程委员会首席顾问朱松春教授指出：日常的蔬菜瓜果清洗方法，对去除食品中的农药残留只起到微乎其微的效果。
浸泡水洗法。绝大部分农药难溶于水，此种方法仅能除极少量的农药污染。其次，水洗会造成水污染，形成农药残留的二次污染。
碱水浸泡法。此种方法也仅能除极少量的农药残留，同样会造成二次污染。针对部分可溶性农药反而有害。可溶性农药遇碱可能发生化学反应，使农药毒性增强，例如，敌百虫在碱性溶液中可变成毒性更强的敌敌畏。
使用洗洁精、洗洁净: 对待这个问题要从多层面考虑。清洗剂都含有表面活性剂，去油能力较强，是化学药剂类，若长期摄入这类物质，则会对人体可能产生蓄积性毒害。
臭氧去除农药残留: 从科学原理方面看此种方法目前仍然有待论证，臭氧在家庭应用中的主要功能表现在杀菌、消毒方面。臭氧具有光谱杀菌性能，是一种无毒气体。臭氧的副作用主要因为它的强氧化能力，在浓度高于1.5mg/l以上时，人员须离开现场，否则会造成呼吸系统的应激性反应，严重的会造成可逆性伤害，铝、铅等金属与臭氧接触会产生氧化腐蚀现象。国外的相关测试显示，臭氧浓度要达到5-30mg/l才会对果蔬残留农药起到一定的作用。然而只要超过浓度1-2mg/l臭氧水的浸泡就会使果蔬漂泊并且严重破坏营养。
生物降解酶法: 去除蔬果残留农药时，在清水中加入生物降解酶，浸泡蔬果即可。浸泡后要用清水冲洗。生物降解酶是一种水解酶，从可食用的酵母菌中提取而来，极易溶于水，它能特异性地水解有机磷农药分子上的磷酸酯键，将有机磷农药分解，分解后的有机磷农药已经不是磷酸酯类化合物，从而完全消除了农药的毒性。因为酶本身就是蛋白质，被广泛应用于食品添加剂和酿酒等，不会像化学合成洗涤剂那样如使用不当还会造成对人体有害的二次污染。生物降解酶法不但高效而且很安全，无毒无副作用，对果蔬的口味和营养价值也没有丝毫的影响，可以直接适用于各种水果、蔬菜、茶叶、谷物、豆类、蛋奶和肉类。过去此法仅在国家重大会议和活动上使用。